学校選びにおいて、通学路の安全性や地域の治安は欠かせない判断軸です。熊本市立出水南中学校 校区は、主に中央区出水や南区出仲間などの住宅エリアに広がっており、熊本市立出水南小学校の卒業生の大半がそのまま進学するコミュニティを形成しています。
この熊本市立出水南中学校 通学区域は、水前寺江津湖公園に隣接する自然豊かな環境でありながら、市電通りや幹線道路（国道57号東バイパスや産業道路）へのアクセスも良好な地域です。古くからの定住層と、新興分譲マンションに移り住んだ子育て世代が程よく共存しており、PTA活動や地域ボランティアの見守り活動が活発なエリアとして知られています。
また、出水南小学校との緊密な「小中連携教育」も強みの一つです。中学校の教員が小学校で出前授業を行ったり、合同の引き渡し訓練・挨拶運動を展開することで、いわゆる「中1ギャップ」を予防する施策が継続されています。小学校時代の人間関係を良好に引き継ぎやすい環境が整っている点は、転居を伴うファミリー層にとっても安心材料となっています。
