湘南新宿ラインのグリーン車に乗車した際、まず頭に入れておくべき結論はシンプルです。グリーン車（4号車・5号車）の中で、トイレが設置されているのは「5号車」だけであり、4号車にはトイレも洗面所も存在しません。乗車前に気になる詳細と混雑回避のコツを整理するため、まずは車両ごとの正確なレイアウトを紐解きます。
湘南新宿ラインで運用されているJR東日本E231系・E233系の車両編成は、10両編成（基本編成：1号車〜10号車）と、その北側（大宮・宇都宮・高崎寄り）に5両を増結した15両編成（1号車〜15号車）の2パターンで運行されています。いずれの編成であっても、グリーン車は必ず4号車と5号車の2両連結で組み込まれています。
具体的な4号車と5号車のデッキ設備の配置を見ると、トイレと洗面所は「5号車の南側（4号車と連結している側のデッキ）」に集約されています。つまり、4号車の座席に座っている乗客も、5号車の座席に座っている乗客も、トイレを利用する際は「4号車と5号車の連結部分（5号車側デッキ）」へ向かうことになります。もし4号車の3号車寄り（小田原・逗子寄り）の階段からデッキへ出てしまうと、そこには普通車3号車との境界扉と乗務員室があるだけでトイレはありません。4号車に乗車している場合は、必ず「5号車方向（大宮・新宿方面を向いて前方、横浜・小田原方面を向いて後方）」の階段を使ってデッキへ出るのが最短ルートです。
また、編成全体のトイレは何号車にあるか詳細まとめとして、普通車を含めた全号車の配置を把握しておくと緊急時に役立ちます。10両編成の場合は「1号車・5号車（グリーン車）・6号車」の計3箇所、15両編成の場合は増結編成の11号車を加えた「1号車・5号車（グリーン車）・6号車・11号車」の計4箇所に設置されています（※小山車両センター所属の初期型E231系1000番台のごく一部で10号車にトイレが残存していたケースを除き、現在は上記号車が共通基準です）。
