「止まったら窒息死するなら、マグロはいつどこで寝ているのか」という疑問は当然湧いてきます。不眠不休で一生を終える生物など地球上に存在するはずがありません。
海洋生物学者のバイオロギング（超小型記録計を魚体に装着する調査）や飼育観察によって、マグロの睡眠方法の実態が詳細に判明してきました。
マグロは睡眠中も「泳ぐのをやめない」のです。ただし、昼間と同じ調子で泳ぎ続けているわけではありません。
夜間になると、マグロは代謝レベルを大幅に落とした「巡航スローモード」へと切り替わります。昼間に餌を追うときのマグロの泳ぐ速度は時速30〜60km、瞬間最高速度では時速80〜100km近くに達しますが、就寝時は時速10〜20km前後の低速にペースダウンします。これはラム換水法による最低限の酸素供給を維持し、沈降を防ぎながら進むことができるギリギリの省エネ速度です。
さらに近年の研究では、マグロなどの大型回遊魚やイルカ・渡り鳥に見られる「半球睡眠（脳の右半球と左半球を交互に休ませる睡眠）」に近い状態をとっている可能性が極めて高いと指摘されています。片方の脳と感覚器で周囲の水流や障害物を感知しながら、もう片方の脳を深く休眠させることで、遊泳と睡眠を同時に成立させているのです。
