東京ドームシティホールの最大の特徴は、一般的な多目的ホールとは一線を画す地下3層構造のすり鉢状レイアウトにあります。施設全体のキャパシティ（収容人数）は、着席時で約2,355人、アリーナをオールスタンディングにした場合は最大3,120人規模となります。
地下3階に位置するアリーナを取り囲むように、地下2階の第1バルコニー、地下1階の第2バルコニー、地上1階の第3バルコニーが馬蹄形に配置されています。この凝縮された空間設計のおかげで、TDCホールの座席の近さと距離感は同規模の会場の中でも群を抜いており、最上階の後方席であってもアリーナクラスの会場のような絶望的な遠さを感じることはほぼありません。
