ドラマ全編を通じて中堂が追い続けた「赤い金魚事件」。その真相と伏線回収は、日本のサスペンスドラマ史上に残る緻密さで構成されています。
被害者の口内に残されていた「赤い金魚」のような奇妙な痕跡は、毒物でも刺青でもなく、「ボール盤（回転式工作機械）の球体アタッチメントを口内に押し込み、窒息死させた際に残る内出血の圧痕」でした。この猟奇的な手口により、アルファベットのAからZに見立てられた26人もの女性が殺害されていたのです。
事件の核心となる真犯人とその動機は以下の通りです。
- 真犯人：高瀬文人（尾上寛之）
不動産屋に勤務する一見おとなしい青年。幼少期に実母からプラスチックケース（衣装ケース）に閉じ込められるなどの深刻な児童虐待を受けて育ちました。「女性をケースに閉じ込めて殺害する」という異常な執着を抱き、8年間にわたり26人を殺害していました。 - 事件の扇動者：宍戸理一（北村有起哉）
宍戸は高瀬の最初の犯行（糀谷夕希子殺害）直後からその正体に気づいていました。しかし警察に通報することなく、自著のノンフィクション本をベストセラーにするため、高瀬の殺人を観察・記録し、次なる犯行を巧妙に示唆・扇動し続けていました。
最終回において、高瀬は警察に出頭するものの、宍戸に証拠をすべて消火器の硫酸で溶かされたため、糀谷夕希子殺害に関する物証が存在せず、不起訴になる危機に直面します。中堂は復讐のために宍戸を毒殺しようと試みますが、ミコトは「中堂さんが不条理に負けるのを見たくない」と叫び、法医学の力で立ち向かうことを誓います。
ミコトたちは、夕希子の遺体が土葬されていたアメリカ・テネシー州から遺体を取り寄せ再解剖を実施。土中で遺体が泥炭化（ボグバディ現象）していたことで、8年前の組織から奇跡的に「犯人の唾液成分」を検出することに成功します。感情的な私的制裁ではなく、「客観的な鑑定データ」によって真犯人を法廷で裁くという結末は、圧巻の伏線回収となりました。
