北村有起哉の家族構成は、本人、妻の高野志穂、そして2人の男の子からなる4人家族です。
長男は2014年11月に誕生し、次男は2026年2月に誕生しました。2026年現在、長男は小学校高学年の11歳〜12歳、次男は活発盛りの5歳を迎えています。
北村自身、家庭では非常に子煩悩な父親として知られており、多忙な撮影スケジュールの合間を縫って学校行事や休日の外遊びに積極的に参加しています。SNSやインタビューでも、息子たちと過ごす飾らない日常や、父親としての成長を実感する言葉が度々語られており、仕事の原動力が家族にあることをうかがわせます。