医療現場でも、耳鼻咽喉科専門医が治療の補助療法として鼻洗浄を推奨するケースが年々増加しています。特に鼻うがいの副鼻腔炎に対する改善効果は臨床的にも広く認められており、副鼻腔内に滞留した膿や粘液を排出し、繊毛運動の機能を回復させる上で大きな役割を果たします。
スギやヒノキなどのアレルギー性鼻炎に対しても、鼻うがいは花粉症の劇的変化をもたらします。抗ヒスタミン薬などの内服薬が「受容体をブロックして症状を抑える」対症療法であるのに対し、鼻うがいは「症状を引き起こす原因物質そのものを物理的に除去する」直接的アプローチです。抗原の曝露量が激減するため、内服薬の減量につながるケースも少なくありません。
さらに近年注目を集めているのが、慢性上咽頭炎に対する鼻うがいの治療効果です。上咽頭の慢性的な炎症は、後鼻漏や喉の違和感だけでなく、慢性疲労や頭痛、微熱といった全身症状を引き起こすことが知られています。塩化亜鉛などを塗布するBスポット療法（EAT）と並行して日々の鼻洗浄を継続することで、上咽頭の炎症環境が鎮静化し、長年の不定愁訴から解放される人が相次いでいます。
