長部田海床路へのアクセスは、車と公共交通機関の双方が利用可能です。熊本市内中心部からは国道57号線（通称：天草街道）を経由して西へ約40分、熊本空港（阿蘇くまもと空港）からは九州自動車道・御船ICまたは松橋ICを経由して車で約1時間で到着します。
公共交通機関を利用する場合は、JR三角線の「住吉駅」が最寄り駅となります。住吉駅からは徒歩約20〜25分（約1.8キロメートル）で住吉海岸公園にアクセスできます。列車の運行本数は1時間に1本程度となるため、事前に往復のダイヤを確認しておくことがスムーズな移動の鍵です。
長部田海床路を組み込んだドライブコースとしては、そのまま国道57号線を南下して天草方面へ抜けるルートが王道です。道中には、美しい砂紋が広がる「御輿来海岸（おこしきかいがん）」や、白亜の三角駅が目を引く三角西港（世界文化遺産）など、宇土半島沿岸の絶景スポットが点在しており、熊本の豊かな海の魅力を1日で巡る贅沢な観光プランが組み立てられます。
