私立高校への進学に伴い、保護者が最も現実的に直視しなければならないのが学費と特待生制度の実態です。
初年度の学費総額は、入学金(約25万円)、授業料、施設設備費、PTA会費、制服・指定品代、修学旅行積立金などを合算すると、概ね100万円前後の資金計画が必要です。2年次以降も年間70万〜80万円程度の維持費がかかりますが、国による高等学校等就学支援金や、埼玉県独自の私立高校父母負担軽減事業補助金を適切に活用することで、世帯年収に応じた実質負担額は大きく軽減されます。
さらに武南高校では、入試成績および中学校の内申点・北辰テスト成績が極めて優秀な受験生を対象とした特待生制度(学業特待・スポーツ特待)を用意しています。特待のランクに応じて「入学金の全額または半額免除」「授業料の全額または半額給付」が適用されます。ただし、特待生資格は単年度ごとに審査され、進級時に所定の評定基準や模試成績を維持できなければ資格剥奪となる規律が存在するため、経済的優遇を前提とする場合は3年間の学力維持に向けた持続的な努力が求められます。