製本テープを貼り終えた後、実務者が最も神経を使うのが契印押印位置の確定です。印鑑を押す場所を誤ると、改ざん防止の効力が十分に発揮されません。
袋とじ製本における契印は、「裏表紙と製本テープの継ぎ目（境界線）」にまたがるように押印するのが正式なルールです。表表紙側に押すケースも見受けられますが、ビジネス実務では「重要事項の合意署名を行う最終ページ（裏表紙側）」に押印を集約させるのが一般的です。製本テープの白い紙質部分と、契約書の印刷用紙部分の双方に、印影が半分ずつ乗るように慎重に押します。
契約の当事者が甲・乙の2社である場合、双方が署名捺印で使用した印鑑（通常は代表取締役印や役職印）と同一の印で契印を行わなければなりません。甲と乙の押印位置は、上下または左右に並べて配置します。どちらが上または左であっても法的効力に差はありませんが、契約書の甲乙表記の順列に合わせ、甲を上（または左）、乙を下（または右）に配置するのが礼儀とされています。
もし契印の押印時に手が滑り、印影がかすれたり二重になったりした場合はどう対処すべきでしょうか。修正テープや修正液の使用は、公的文書において厳禁です。失敗した印影の真横に、境界線をまたぐ形で改めて鮮明に押し直してください。元の不鮮明な印影に対して二重線を引いて訂正印を押す方法もありますが、書類の見栄えを損ねるため、余白があるならば失敗した印影のすぐ隣に正規の印影を押し直す処理が実務上広く容認されています。
