テレビでは知的で隙のない司会進行を見せる上田ですが、プライベートや家族関係においては非常に温和で愛情深い一面を持っています。
私生活では2004年に一般女性と結婚し、現在は子煩悩な父親として知られています。多忙なスケジュールの合間を縫って子どもの行事に参加するなど、家庭内では穏やかな良きパパとしての顔を大切にしています。
また、ファンの間で広く知られているのが、熊本でタレント・番組制作プロデューサー・実業家として活躍する実兄・上田啓介氏との関係です。バラエティ番組などで兄のエピソードが語られることも多く、破天荒で愛嬌のある兄と、それに呆れつつも深い愛情とリスペクトを寄せる弟・晋也の兄弟関係は、視聴者に強い親近感を与えています。地元・熊本への思い入れも深く、震災復興支援など故郷への貢献を陰ながら続ける姿勢も高く評価されています。