中古市場やフリマアプリで『サン・ムーン』を購入したユーザーや、ひかるおまもり回収のために周回を行うプレイヤーのコミュニティでは、データ削除にまつわる様々なトラブルが報告されています。
インターネット上の質問掲示板やSNSでは、「前所有者のデータで最初から遊ぼうとしてセーブができず、数時間のプレイが無駄になった」という悲痛な声が散見されます。前述の通り、ポケモンSMには上書き防止システムが搭載されているため、タイトル画面で「セーブデータを初期化」せずに「さいしょからはじめる」を選んで進行しても、レポートを書く段階で弾かれてしまう仕様です。中古ソフトを入手した際は、プレイを開始する前にまずコマンドを入力してメモリをまっさらな状態に戻す作業が必須となります。
また、リセットを繰り返す「ソフトリセット（L ＋ R ＋ START または SELECT）」と「データ初期化（十字上 ＋ B ＋ X）」を取り違え、「リセットしたのに前のデータが残っている」と勘違いする初心者も少なくありません。ソフトリセットは単なる再起動であり、データは消去されないという基本仕様を再認識しておく必要があります。
