体に良いからといって、無制限に食べまくれば良いというものではない。知られざる注意点も存在する。スプラウトに含まれる辛味成分（イソチオシアネート類）は刺激が強く、空腹時に一度に大量摂取すると胃腸が荒れたり、腹痛や胸やけを引き起こすリスクがある。特に胃腸が過敏な人は注意が必要だ。
また、生のまま食べる新鮮な野菜である以上、衛生管理や保存状態を怠ると雑菌繁殖のリスクが伴う。市販のパックは購入後速やかに冷蔵保存し、日持ちさせずに新鮮なうちに使い切ることが鉄則だ。さらに甲状腺疾患の持病がある人は、アブラナ科野菜に含まれるゴイトロゲンという成分の摂取量について主治医に相談しておくのが望ましい。どれほど優れた健康食材も、適正量を見極めてこそ安全に真価を発揮する。
