私生活では、1973年に元フジテレビの敏腕プロデューサー・ディレクターであった岡田太郎(おかだ たろう)氏と結婚しました。当時、吉永さんが28歳、岡田氏が43歳という15歳の年齢差や電撃婚であったことから、世間では大きな話題を呼びました。
結婚当時、多忙によるストレスから声が出なくなるなど心身の不調に悩まされていた吉永さんを、精神的・私生活の両面で温かく支え続けたのが岡田氏でした。料理や家事をともに楽しみ、仕事の良き理解者として吉永さんの女優人生をバックアップし続けたおしどり夫婦として知られています。
お二人の間に子供はいません。吉永さんはかつてインタビューなどで「子供のいる人生も素敵だと思うけれど、仕事と家庭に全力を注いできた」という趣旨を述べており、夫婦ふたりの時間を大切にしながら、一本一本の映画制作に人生を捧げてきました。互いを尊重し合うパートナーシップの存在が、女優・吉永小百合の精神的な安定と輝きを支えてきたことは間違いありません。