ミュージアムのすぐ隣に鎮座する「武蔵野坐令和神社(むさしのれいわじんじゃ)」は、建築家・隈研吾氏がデザインを手掛けた近未来的な神社です。社号は元号「令和」にちなんで名付けられ、ポップカルチャーの聖地を見守る守護神として建立されました。
拝殿の天井には、『ファイナルファンタジー』シリーズのキャラクターデザインで世界的に知られる天野喜孝氏が描いた鳳凰の天井画が掲げられており、現代アートとしても必見の価値があります。授与所ではスタイリッシュなデザインの限定御朱印や、クリエイター向けの「締切守」「芸上達守」など、ユニークなお守りが人気を集めています。
また、本館2階にある「ダ・ヴィンチストア」は、単なる本屋を超えた「発見と体験」を提供するコンセプトストアです。「発見×連想×展開」をテーマに独自の切り口で棚が編集されており、普段出会えない本や限定グッズ、KADOKAWA人気作品のオフィシャルショップが並び、知的な刺激に満ちた時間を過ごせます。