館内へ足を踏み入れると、まず目を奪われるのが屋外型の九十九島湾大水槽です。屋根のないオープンエア構造を採用しており、自然の太陽光が水面を通して水底までまっすぐに差し込みます。天候や時間帯によって刻一刻と表情を変える光の筋と、約120種13,000匹もの生きものたちが織りなす群泳は息をのむ美しさです。
浅瀬の岩場から深海へと続く九十九島のリアルな生態系が再現されており、悠然と泳ぐトビエイやウシバナトビエイ、銀色に輝くイワシの群れなど、自然界に近いありのままの姿を観察できます。館内の回廊を進むにつれて異なる角度や深さから観察できる立体的な構造も見逃せません。
さらに奥へと進むと現れるのが、西日本最大級のクラゲ展示エリアであるクラゲシンフォニードームです。薄暗いドーム状の空間にオリジナルブレンドの優雅な音楽と幻想的なライティングが響き渡り、大小さまざまな水槽でたゆたうクラゲたちが非日常の癒やしを演出します。併設された「クラゲ研究室」では、新種のクラゲ発見や繁殖に関する学術的な取り組みも分かりやすく紹介されています。
