旅の質を決定づける客室内部の設備については、長期滞在を前提とした設計思想が貫かれています。室内には大型冷蔵庫、電子レンジ、IH調理器具、調理器具一式、食器類が備え付けられており、地元スーパー「サンエー」や市場で仕入れた食材を自由に調理可能です。特に、小さな子ども連れのファミリー層からは「外食続きで疲弊する胃腸を休める自炊ができる」との手記が多数寄せられています。
滞在快適度を左右するアクアリゾートイン北谷 アメニティおよび設備仕様の現況は以下の通りです。
- 水回り設備：独立洗面台、温水洗浄便座、追い焚き機能付きまたは広めのバスタブ付きバスルーム（客室タイプによる）。
- ランドリー設備：各室専用の全自動洗濯機およびガス衣類乾燥機を設置。洗剤も初期備え付けがあり、マリンアクティビティ後の水着や日々の着替えを即座に洗濯・乾燥可能。
- リネン・アメニティ：タオル類、シャンプー、コンディショナー、ボディソープ、歯ブラシなどの基本セットを完備。ただし、滞在中の毎日の清掃やタオル交換は省かれているプランが多いため、自身での洗濯運用が前提となります。
また、旅の到着時に重要となるアクアリゾートイン北谷 チェックインの手続きは、エントランスおよび客室ドアのスマートロック（暗証番号入力式）を採用したセルフ方式が主流です。フロントの順番待ちで貴重な観光時間を浪費することなく、事前通知されたPINコードでスマートに入室できる点は、タイパ（タイムパフォーマンス）を重視する旅行者から絶大な支持を得ています。
