高い人気を誇る一方で、事前に知っておかないとチェックイン当日に戸惑いやすいポイントがいくつか存在します。最も多い誤解と注意すべき盲点は「アクセス経路の急勾配」「送迎バスの運行スケジュール」「日帰り温泉の利用条件」の3点です。
第一に、ホテルは稲佐山の中腹という絶景ロケーションに位置しているため、周辺は非常に傾斜のきつい坂道が続きます。「長崎駅から散歩がてら歩いて向かう」ことは実質的に不可能です。マイカーやレンタカーを利用する場合は長崎ICから約20分、無料駐車場（約80台・予約不要）が利用できますが、道幅が狭くカーブが続く箇所があるため、運転に不安がある方はJR長崎駅から運行されている無料送迎バス（所要時間約15分）を積極的に利用するのが賢明です。送迎バスの運行ダイヤは事前に公式サイトで確認しておくとスムーズに移動できます。
第二に、ネット上でよく検索される「日帰り温泉」についてです。長崎ホテル清風は宿泊者向けの滞在クオリティを最優先に確保しているため、日帰り入浴の営業時間が限定的であるか、時期や混雑状況によって受け入れを休止している場合があります。「ふらっと立ち寄り湯ができる」と思い込んで現地を訪れると利用できないリスクがあるため、日帰り利用を検討している場合は当日の受入状況を必ず事前に電話確認してください。
