癌封じ神社にまつわる最大の誤解は、「癌封じ神社＝治癒のための最終手段」という捉え方だ。実際には、癌封じ神社は病気平癒を願う「予防的信仰」の側面も強く、健康なうちから参拝し、身体の異変がないことを感謝する「癌封じ祈祷」も広く行われている。特に福岡の筥崎宮では、癌検診と併せて参拝する「癌封じツーリズム」とでも呼ぶべき新しい動きが生まれており、地元医療機関との連携イベントも開催されている。
また、癌封じ神社の御利益を過度に宣伝する一部のスピリチュアル業者の存在も無視できない。ネット上には「癌封じ神社の御祈祷で癌が消える」といった過激な謳い文句で高額な「代行参拝」や「特別祈祷」を販売する業者も存在するが、これは神社本庁などの正式な見解とはまったく異なる。公式発表資料によれば、神社の祈祷はあくまで「心の平穏と前向きな生きる力を得るためのもの」であり、医学的治療の代替として宣伝することは不適切であるとの立場が示されている。
