ポンカンを食べる際、多くの人が最初に疑問を抱くのが「ポンカンの薄皮は食べられるか」という点です。結論から言えば、果肉を包んでいる薄皮（専門用語でポンカンじょうのう膜）は、そのまま丸ごと食べて全く問題ありません。
八朔（はっさく）や文旦などの大型柑橘は薄皮が硬く苦味があるため剥いて食べるのが一般的ですが、ポンカンの薄皮は非常に薄く、口の中に残りにくいしなやかな肉質をしています。無理に薄皮を剥こうとすると、果汁が外へ逃げてしまい本来のジューシーさが損なわれてしまいます。
さらに、このじょうのう膜や白い筋（アルベド）には、水溶性食物繊維（ペクチン）や血流改善・毛細血管強化を助けるポリフェノールの一種「ヘスペリジン」が豊富に含まれています。栄養面と風味の両面から見ても、外側の厚い皮だけを剥いて薄皮ごと頬張るのが最も合理的で贅沢な味わい方です。
