透明度の高い海を見るとシュノーケリングや遊泳を試みたくなるものですが、木綿原ビーチでのマリンレジャーには十分な警戒が必要です。
最大の注意点は、クラゲ防止ネットがなく、監視員・ライフセーバーが一切配置されていない点です。ハブクラゲの発生シーズン（主に6月〜10月）には刺傷被害のリスクが高まります。肌の露出を避けるラッシュガードやウェットスーツの着用が欠かせません。
また、遠浅のリーフ地形特有の「リーフカレント（離岸流）」にも注意を払う必要があります。干満の差が激しく、大潮の干潮時には沖合まで干潟のように浅くなりますが、満潮に向かう時間帯や外洋へ抜ける水路（リーフギャップ）周辺では強い引き波が発生します。単独での遊泳や深い場所へのアプローチは避け、ライフジャケットを必ず着用したうえで、海況を正確に見極めるスキルが必要です。
