尿の臭いが変化する背景には、男女特有の解剖学的構造やホルモンバランスの違いも関与しています。
女性における尿の臭いの主な原因としては、尿道が約3〜4cmと短く細菌が膀胱に侵入しやすい構造であることから、膀胱炎や尿道炎の発症頻度が非常に高い点が挙げられます。また、細菌性膣症やトリコモナス膣炎などの婦人科系感染症によって帯下（おりもの）が混入し、排尿時に生臭い悪臭を感じるケースも少なくありません。閉経後は女性ホルモンの低下によって膣や尿道の粘膜が菲薄化し、自浄作用が落ちることで萎縮性膣炎から異臭を生じやすくなります。
対して男性における尿の臭いの原因では、加齢に伴う前立腺肥大症や慢性前立腺炎が引き金となるケースが目立ちます。前立腺が肥大して尿道を圧迫すると、排尿後も膀胱内に尿が残る「残尿」が発生しやすくなります。膀胱内に溜まった尿が長時間滞留することで細菌が繁殖し、ツンとするアンモニア臭や濁った悪臭を引き起こすのです。
