『古事記』および『日本書紀』において、天地開闢の際に天沼矛（あめのぬぼこ）から滴り落ちた潮が固まってできたとされるのが「オノゴロ島」です。おのころ島神社（自凝島神社）は、この伝説の島そのものである小高い丘の上に社殿を構えています。
主祭神には、日本列島と八百万の神々を生み出した夫婦神である伊弉諾命（イザナギノミコト）と伊弉冉命（イザナミノミコト）が祀られています。二神は日本最古の婚姻を結んだ存在であることから、古来より「縁結び」「夫婦円満」「安産祈願・子授け」の根源神として篤い信仰を集めてきました。
さらに注目すべきは、二神の仲を取り持ったとされる調停の神、菊理媛命（ククリヒメノミコト）が合祀されている点です。男女の結びつきだけでなく、もつれた人間関係を結び直す「復縁」や「良縁成就」において絶対的な神威を持つとされる理由は、この三神が揃い踏みしている祭祀構造に由来しています。
境内入り口にそびえ立つ朱塗りの大鳥居は、昭和57年（1982年）に建立されたもので、高さ21.7メートルを誇ります。京都の平安神宮、広島の厳島神社と並び「日本三大鳥居」の一つに数えられることが多く、その威容は淡路平野のランドマークとして訪れる者を圧倒します。
