ネット上の情報では「完璧なリゾートホテル」として語られがちですが、実際に滞在する際にはいくつかの注意すべきポイントが存在します。
まず誤解されやすいのが、新浦安駅からのアクセスです。ホテルはJR新浦安駅から海側に離れたエリア（明海地区）に位置しており、駅から徒歩で向かうのは現実的ではありません（徒歩約30分）。新浦安駅からは路線バス（東京ベイシティ交通）で約10〜15分、またはタクシー利用（約1,200円〜1,500円）が必須となります。舞浜駅から無料シャトルバスを利用するのが基本動線となりますが、JR京葉線で新浦安駅に到着した場合は移動手段をあらかじめ確認しておく必要があります。
次に、三井ガーデンホテルプラナ東京ベイの駐車場料金と時間の仕組みです。1泊あたり30時間（例：入庫から30時間まで一律料金）という非常にゆとりある駐車枠が設定されており、パーク開園前の早朝に車を預けてシャトルバスで向かうことができます。ただし、チェックアウト日の夕方以降まで駐車を延長する場合、規定時間を超えると追加料金が発生するため、帰りのスケジュールに合わせた駐車時間の管理が求められます。
