御金神社を訪れる際に最も警戒すべきリスクが、現地周辺の交通・駐車事情です。境内には参拝者専用の駐車場および駐輪場は一切ありません。周辺のコインパーキングは収容台数が極めて少なく、京都中心部の観光地価格(30分500円〜800円前後)が適用されているため、満車による入庫待ちや高額な駐車料金に直面する危険があります。
アクセスは公共交通機関の利用が鉄則です。京都市営地下鉄「烏丸御池駅」2番出口から徒歩約5分、もしくは「二条城前駅」2番出口から徒歩約5分と、駅からのアクセスは非常に良好です。
また、住宅密集地であるため、深夜・早朝の私語や路地での長時間の立ち止まり、近隣住宅の敷地前での撮影は厳禁です。静謐な環境を守ることが参拝者としての最低限の礼儀となります。
古くなったお札や御金神社のお守り返納については、境内に返納箱が設けられています。1年間ご加護をいただいた福財布やお守りは、感謝の気持ちとともに古札納所へ納めるか、遠方の場合は神社宛てに感謝の手紙を添えて郵送で納めるのが作法です。