「ある日突然、舌が割れたように見えた」と感じる人が多い溝状舌ですが、その発症メカニズムには複数の先天的・後天的ファクターが複雑に絡み合っています。
根本的な要因として挙げられるのが先天的な遺伝的素因です。生まれつき舌の形態形成段階で溝ができやすい体質があり、家族内で同じような舌の形状が見られるケースは珍しくありません。また、ダウン症候群やメルカーソン・ローゼンタール症候群（顔面神経麻痺・溝状舌・口唇腫脹の3徴を特徴とする疾患）などの合併症状として現れることも広く知られています。
一方で、大人になってから溝が急激に深くなったり違和感を覚えたりする場合、以下の後天的な全身環境の悪化が引き金となります。
- 自律神経の乱れと過度なストレス：慢性的なストレスは交感神経を優位にし、唾液の分泌量を著しく低下させます。口腔内が乾燥（ドライマウス）すると舌粘膜の弾力性が失われ、亀裂がより深く割れやすくなります。
- ビタミンB群・微量ミネラルの不足：特にビタミンB2、B6、B12、葉酸、亜鉛、鉄分の欠乏は、粘膜の再生修復ターンオーバーを停滞させ、舌炎や粘膜萎縮を引き起こします。偏食や極端なダイエットが背景にある若い世代にも増えている傾向です。
- 地図状舌（ちずじょうぜつ）との併発：舌の表面に赤白いまだら模様ができる地図状舌と溝状舌は、約20%〜30%の割合で併発することが確認されています。粘膜表層の剥離と溝の形成が同時に進行することで、刺激物への過敏反応が強まります。
