自家製柚子茶を美味しく、かつ長期保存に耐えうる糖度で仕上げるための鉄則は、柚子の正味重量に対して糖分を同量（1：1）で合わせることです。糖度をむやみに下げてしまうと、防腐効果が著しく低下して発酵やカビの原因となるため注意が必要です。
使用する甘味料の特性によって、仕上がりの風味や使い勝手は大きく変わります。
- 砂糖（上白糖・グラニュー糖）：すっきりとした甘さで柚子の柑橘香がダイレクトに際立ちます。グラニュー糖を使うとクリアで濁りのない美しいシロップに仕上がります。
- はちみつ：濃厚なコクとまろやかな風味が加わり、喉をいたわる保湿感が増します。はちみつのみで漬けるとやや固まりやすいため、砂糖と半分ずつ（柚子500gに対し、砂糖250g＋はちみつ250g）合わせるブレンドが最もバランスに優れています。
- 氷砂糖：時間をかけてじっくりと浸透圧でエキスを抽出するため、皮の組織が崩れず、透明度の高い上品な柚子シロップを作りたい場合に向いています。
なお、一般的な「柚子ジャム」が全体を鍋でじっくり煮詰めてゼリー化（ペクチンのゲル化）させるのに対し、伝統的な柚子茶は生の果皮と果汁を糖漬けにして熟成させるのが大きな違いです。加熱を最小限に抑えることで、生のフレッシュなアロマをそのまま楽しめます。
