一般の利用希望者から特に問い合わせが多いのが、バドミントンや卓球の個人利用です。総合体育館では、専用利用が入っていない時間帯や曜日ごとに設定された「一般開放枠」において、コート単位・台単位で当日先着順の個人利用が認められています。ネットの設営や片付けは利用者同士で協力して行うのが慣例です。ラケットやシャトルなどの用具は原則として持参が必要となります。
また、「体育館内に温水プールはあるか？」という疑問を抱く方が少なくありません。大垣市総合体育館の館内自体には水泳プール施設は常設されておらず、水泳を行いたい場合は近隣の市営プール（大垣市民プールなど）や周辺の温水プール施設を併用する形になります。球技・フロアスポーツと水泳では窓口や利用施設が異なる点をあらかじめ押さえておくと迷いません。
