阪南大学高等学校を語る上で欠かせないのが、全国高等学校サッカー選手権大会やインターハイ（全国高校総体）で上位進出の実績を誇るサッカー部の存在です。南大阪を代表するサッカー強豪校として、Jリーガーや大学サッカー界で活躍する選手を多数輩出しています。
学校敷地内や専用グラウンドには人工芝ピッチをはじめとするハイレベルな練習環境が整備されており、府内外から実力派の選手が集まります。入部希望者向けに開催される練習会・セレクションは毎年高い倍率となり、部内でのポジション争いも非常に熾烈です。
部活動に関する保護者の声として「勉強との両立ができるのか」という懸念が挙げられますが、サッカー部所属生の多くは総合進学コースに在籍しながら、日々のトレーニングと定期試験対策のメリハリをつけて生活しています。文武両道を徹底させるための指導が行き届いており、生活態度の乱れに対しては厳格な指導方針が敷かれています。
