藤沢台小学校を卒業する児童の進路において、標準的なルートとなるのが富田林市立金剛中学校への進学です。金剛中学校には藤沢台小のほかに向陽台小学校などの出身者が合流しますが、小学校段階から合同交流や教員間の情報共有が行われているため、中学校生活への適応ギャップ（いわゆる「中1ギャップ」）が起きにくい構造が作られています。
同時に、近年注目を集めているのが藤沢台小学校の中学受験事情です。同校区から通学可能な距離には、高い大学進学実績を誇る大阪府立富田林中学校・高等学校（併設型中高一貫校）が位置しており、公立中高一貫校への適性検査受検を目指す児童が年々増加傾向にあります。
さらに、南海高野線や近鉄長野線を利用して、清風南海、帝塚山学院泉ヶ丘、初芝富田林、大谷といった南大阪・奈良エリアの有力私立中高一貫校へと進学する家庭も定着しています。学校全体が過度な受験偏重に傾くことなく、公立進学組と受験組が互いを尊重し合える適度な学習空気が保たれている点が、藤沢台小学校の際立った特長です。
