多くのプレイヤーが検索窓に「にゃんこ大戦争のコード入力場所はどこ？」と打ち込む最大の理由は、過去のゲーム攻略記事やYouTubeの過去動画に「シリアルコード入力で限定キャラ獲得」という情報が残っているためです。しかし、にゃんこ大戦争のシリアルコードは現在、スマートフォン版（iOS／Android）において完全に機能が停止しています。
かつてはタイトル画面のオプションや「にゃんこクラブ」付近から専用の入力ページへアクセスできましたが、バージョン5.6.0のアップデートを境に機能そのものが削除されました。現在、アプリ内メニューやWEB上の入力フォームを探しても見つからないのは、システム自体が撤去されているからです。
一方で、家庭用ゲーム機としてリリースされているNintendo Switch版『ふたりで！にゃんこ大戦争』では、パッケージ版の購入特典や関連グッズに付属するダウンロード番号（シリアル番号）をニンテンドーeショップ等で入力する仕様が存在します。この「Switch版のコード入力」と「スマホ版の仕様」がネット上で混同されて拡散されていることも、プレイヤーの混乱に拍車をかけている要因の一つです。
