多くの人が混同しがちなのが「乳酸菌」と「ビフィズス菌」の違いである。両者は作用する主な部位も産生する物質も大きく異なる。乳酸菌は主に小腸で働き、乳酸を作り出して悪玉菌の繁殖を抑える。一方、ビフィズス菌は大腸に多く存在し、乳酸だけでなく強い殺菌力を持つ酢酸を作り出すのが特徴だ。
腸内細菌叢（腸内フローラ）の構成は、指紋のように一人ひとり全く異なる。ある人にとって劇的な効果をもたらすプロバイオティクスが、別の人にとっては悪夢のような腹痛を引き起こす原因になるのはこのためだ。市場にあふれる製品の「菌株の種類」や「生菌・死菌の違い」を考慮せず、他人の成功体験だけで製品を選ぶことが、ミスマッチを引き起こす最大の要因といえる。
