苫小牧からフェリーに乗る際、もっとも警戒すべきが「苫小牧西港フェリーターミナル」と「苫小牧東港周文フェリーターミナル」の混同です。名前は似ていますが、地理的にはまったく別の場所に位置しています。
西港は苫小牧市街地やJR苫小牧駅に近く、飲食店や売店、展望デッキが充実した大規模複合ターミナルです。一方の東港は、厚真町に近い工業地帯の静穏な海域にあり、周囲に商業施設はほとんどありません。両ターミナル間は車で約35分から40分（約30km）離れており、出発直前に間違いに気づいた場合、移動が間に合わず乗船を断念せざるを得ないケースが後を絶ちません。
就航している船会社と発着路線は以下のように明確に分かれています。
【苫小牧西港発着の航路】
・商船三井さんふらわあ：大洗（茨城県）行き
・太平洋フェリー：仙台（宮城県）経由・名古屋（愛知県）行き
・シルバーフェリー（川崎近海汽船）：八戸（青森県）行き
【苫小牧東港発着の航路】
・新日本海フェリー：敦賀（福井県）直行便・新潟（新潟県）経由敦賀行き／秋田・新潟経由寄港便
苫小牧東港フェリー乗り場へのアクセスは、車の場合は日高自動車道の苫東中央ICまたは厚真ICを利用します。公共交通機関を利用する場合は、JR南千歳駅や苫小牧駅から運行されている連絡バス（完全予約制の場合あり）の利用が必須となるため、事前に接続ダイヤを必ず確認してください。
