山形における納豆餅の歴史は、豊かな稲作文化と大豆栽培の歴史に直結しています。厳しい冬を迎える東北の山間部において、保存食である大豆を発酵させた納豆と、収穫したもち米から作る餅は、冬場の貴重なタンパク源かつエネルギー源でした。
特に山形県村山地方の餅文化は非常に多彩で、あんこ、きな粉、ごま、納豆、ずんだ(じんだん)、くるみなど、多様なタレで餅を味わう「餅振る舞い」の伝統が色濃く残っています。その中でも納豆餅は、甘いタレが続く中での塩気と旨味のアクセントとしても重宝されてきました。
また、正月における納豆餅の風習も見逃せません。山形県内の一部の地域では、元旦の朝や1月2日・3日の朝食に納豆餅や納豆汁を食べる風習があります。「粘り強く一年を過ごせるように」「豆(マメ)に働けるように」という無病息災や家内安全の祈りが込められており、ハレの日の儀礼食としても生活に根付いています。