コナンカフェの大きな魅力であり、ファンの熱狂を加速させているのが豪華な限定アイテム群です。特に注目を集めているのが、1席あたり税込715円〜880円前後で設定されているコナンカフェ横浜事前予約特典です。事前予約を経て入店し、カフェメニューを注文した来場者全員に、2026年限定デザインのオリジナルPPうちわやステッカー、クリアしおりなどの非売品プレミアムノベルティがランダムで進呈されます。
また、物販コーナーに並ぶコナンカフェ横浜限定グッズは、コレクター垂涎のラインナップとなっています。描き下ろしイラストを使用した缶バッジ、アクリルスタンド、アクリルキーホルダーなどのブラインド仕様アイテムはもちろん、横浜会場の港町モチーフを取り入れた限定デザインのアパレルやマグカップは、初動数日で一時品切れを起こすほどの人気ぶりです。
ここで注意すべきは、グッズ売り場への入場ルールです。混雑防止のため、多くの日程で「カフェ飲食利用者のみ物販購入可能」という購入制限が敷かれています。また、1会計あたりの購入個数制限（ランダム商品は1人10点〜20点まで、オープン商品は1人2点まで等）が厳密に設定されているため、レジ前で慌てないよう事前に購入希望リストを確定させておくことが肝要です。
