必由館高校の活気ある校風を語るうえで欠かせないのが、高い実績を誇る部活動の存在です。「文武両道」をスローガンに掲げる高校は数多く存在しますが、同校の打ち立てる戦績は名実ともに熊本県トップレベルに位置します。
象徴的なのが、必由館高校 部活動 野球部 実績です。かつて共学化からわずかな年月で甲子園出場を果たし、プロ野球界にも阪神タイガースの岩貞祐太投手をはじめ複数のプロ選手を送り込んだ歴史は広く知られています。現在も限られたグラウンド環境と練習時間のなかで、徹底した状況判断と科学的トレーニングを組み合わせ、県大会の上位常連校として私学強豪校と堂々たる勝負を繰り広げています。
文化部において全国区の知名度を誇るのが必由館高校 吹奏楽部です。全日本吹奏楽コンクールやマーチングコンテストでの輝かしい入賞歴を持ち、地域イベントや定期演奏会でも圧巻のパフォーマンスを披露しています。練習の厳しさは県内有数と評されるものの、部員同士の強固な結束と圧倒的な達成感は、生徒たちの人間的成長を促す大きな原動力となっています。このほか、和太鼓部や弓道部、陸上競技部なども活発に活動しており、部活動に全力を注ぎながら現役で国公立大学に合格する生徒が多い点も同校の大きな特徴です。
