初めて一由そばを訪れる人が少し緊張するのが、カウンター越しにテンポよく交わされる独自の注文システムです。店内に入ったら食券機を探す必要はありません。一由そばは完全口頭注文・後会計スタイル（テイクアウト時は先払いの場合あり）を採用しています。
スムーズに注文するための黄金ステップは以下の通りです。
- ステップ1（麺と量の選択）：そば、うどん、細うどん、きしめん等から選び、量（小盛・普通・大盛・特盛など）を伝えます。噛み応え抜群の極太麺が好きな方は、ここで「太打ちそば（限定）」をコールしましょう。
- ステップ2（温・冷の指定）：「温かいの（温）」または「冷たいの（冷）」を指定します。
- ステップ3（トッピングの指定）：「ジャンボゲソ天」「紅生姜天」「JKB（じゃこ天・紅生姜・ネギのかき揚げ）」など好みの具材を伝えます。
- ステップ4（薬味のセルフサービス）：商品を受け取ったら、カウンターに置かれた「ネギ」と「一味・七味」を自分の好みの量だけトッピングして席（立ち食いスペース）へ移動します。
