液体窒素治療（凍結療法）は、綿棒や専用のスプレー（クライオガン）を用いて患部を急激に凍結・融解させ、ウイルスに感染した表皮細胞を物理的に壊死（ネクローシス）させる治療法です。皮膚科の臨床現場（アイシークリニック等の治療実績データ）および患者の経過観察記録から判明している、治療開始から脱落までの典型的なフェーズは次の通りです。
【第1段階：施術直後〜翌日】白色化から赤・黒への変色
照射直後は凍結によって患部が白く凍りつきます。数分で解凍されると強い赤みと腫れが生じ、内部で微小出血が起こることで徐々に暗褐色〜黒色へと変化します。この変色は細胞が壊死し、かさぶた化（凝固壊死）が始まった証拠です。
【第2段階：3日目〜1週間】水ぶくれ・血豆の形成とかさぶたの硬化
凍結の深さに応じて、患部の下に漿液（水ぶくれ）や血液混じりの液体（血豆）が溜まることがあります。患部はカチカチに硬い黒色のかさぶたへと移行し、触ると盛り上がりを感じる状態になります。
【第3段階：1週間〜2週間】「取れる前兆」と自然脱落（ポロリ）
壊死した組織の下で基底層から新しい正常な皮膚が再生してくると、黒いかさぶたの縁（フチ）が浮き上がり、皮膚との間に隙間ができてきます。これが明確な「取れる前兆」です。入浴中や着替えの摩擦などで自然にポロリと剥がれ落ち、下からピンク色の新しい皮膚が露出します。
ただし、1回の脱落で深部に潜むヒトパピローマウイルス（HPV）が全滅するとは限りません。残存している場合は、皮膚が落ち着いた1〜2週間後に再び液体窒素を照射するサイクルを繰り返します。
