事件現場となった山梨県南都留郡道志村の椿荘オートキャンプ場周辺は、観光地として整備された区画のすぐ裏手に、標高1,000メートル前後の急峻な山岳地帯が連なっています。現場周辺の地図を俯瞰すると、キャンプ場と山林の境界には明確な防護柵などはなく、林道や作業道が複雑に入り組む構造になっていました。
子供の歩幅でも、大人が目を離したわずか数分の間に誤った分岐ルートへと進入してしまうことは十分に起こり得ます。山岳遭難の専門家が指摘するのは、「子ども特有の心理行動」と「地形の錯覚」です。幼少児は道に迷った際、下山するのではなく「上へ登ろうとする（見晴らしの良い場所を求める）」傾向や、視界の開けた尾根筋へ吸い寄せられる習性があります。
美咲さんが迷い込んだとみられるルートは、進むにつれて道幅が狭まり、傾斜角度が急激に増す枯れ沢へと繋がっていました。沢沿いは足元が滑りやすく、左右が崖状になっているため、一度滑落や転落を起こすと自力での脱出は極めて困難になります。
一方で、美咲ちゃん事件の真相を巡っては、「事件か事故か」という議論が長期にわたり繰り広げられました。発見された遺体の一部には動物による損壊の痕跡が見られたものの、骨自体に致命的な人為的外傷（刃物等による切創）は確認されませんでした。山梨県警は連れ去り等の事件性と、道迷いによる滑落・低体温症などの事故性の双方を排除せず慎重に捜査を継続してきましたが、第三者の関与を裏付ける決定的な物証は得られていません。
