組織の存続を根底から揺るがしたのが、かつて発生した二つの「会津小鉄会」が並立する前代未聞の分裂事態である。この内部抗争の背景には、日本最大の指定暴力団である六代目山口組と、そこから派生した神戸山口組との熾烈な主導権争いが深く関与していた。関西の要衝である京都をめぐる巨大組織同士の思惑が、伝統団体の継承問題と複雑に絡み合い、深刻な亀裂を生み出したのである。
ニュースアーカイブデータベースに残された当時の捜査記録や報道によれば、一時は事務所への突入や路上での衝突など一触即発の緊張が続いたが、当局の徹底した取り締まりと断続的な水面下の交渉を経て、現在の統一体制へと集約された。しかし、六代目山口組との距離感や外交姿勢をめぐる内在的リスクは、今なお組織の最新動向に微妙な影響を与え続けている。