コストコ中部空港倉庫店を訪れる上で最大の関門となるのが、土日祝日のフロアおよびレジの混雑です。公式の基本営業時間は10:00〜20:00と設定されていますが、週末や大型連休には混雑緩和のため9:00前後（状況により8:30頃）に前倒しオープンすることが常態化しています。
店内の混雑ピークは11:00〜15:30。この時間帯はメイン通路がカートで埋め尽くされ、試食コーナーやデリカコーナー周辺の移動にストレスがかかります。スムーズに買い物を完了させたい場合、狙い目は以下の2つのタイムゾーンです。
1つ目は、「朝8時45分着のアーリーエントリー」です。前倒しオープンのタイミングで入店できれば、デリカやベーカリーの出来立てを確保しつつ、10時前にはレジを通過できます。2つ目は「18:00以降のレイトショッピング」。ファミリー層が退店し始める夕暮れ以降は、カートのすれ違いも容易になり、フードコートの行列も大幅に短縮されます。
なお、Googleマップの「混雑する時間帯」機能やSNSでのリアルタイム投稿（「#コストコ中部空港」等）を直前にチェックすることで、突発的な入場規制やレジ待ち列の長さを事前に把握できます。
