長崎出島で数日間にわたってさらされた後、天草四郎の首級は一体どこへ運ばれ、どこに眠っているのでしょうか。歴史の記録と伝承を辿ると、いくつかの重要な天草四郎の墓の場所や首塚が存在します。
現在知られている主な史跡は以下の通りです。
長崎で役目を終えた首級の行方については、「海へ投棄された」とする記録がある一方で、「生き残ったキリシタンの手で極秘裏に奪還され、故郷の天草や原城へ埋め戻された」という言い伝えも根強く残っています。現在、原城跡の本丸跡に佇む「天草四郎の像」と祈りの墓碑には、今も全国から多くの参拝者が訪れ、非業の死を遂げた少年へ祈りを捧げています。