メガトウキョーへの入場で最も混乱を生んでいるのが、事前予約の真相と当日配布の整理券システムです。ネット上では「完全予約制になった」「誰でも並べば入れる」といった新旧の情報が錯綜していますが、2026年現在の運用は「特定日事前Web抽選」と「当日現場デジタル整理券」のハイブリッド形式が主流となっています。
大型新商品（特に拡張パックや季節限定記念グッズ）の発売初週末や、大型連休（GW・春休み・夏休み）などは、公式LINEミニアプリ等を通じた事前入店予約が適用されます。この期間は、事前枠の当選画面を持たない一般客は夕方まで一切フロアに立ち入ることができません。
一方、事前予約が課されない通常の週末であっても、午前中から現地での整理券配布が即座に発動します。整理券配布時間の実態を追跡すると、週末はサンシャインシティの開門（専門店街アルパは通常10時オープン）に先駆け、指定待機場所（主にアルパ地下1階の催事場付近や指定階段通路）にて午前8時30分から9時台には配布が開始されるケースが常態化しています。
整理券の配布スピードは驚異的で、人気商品が重なる日には午前10時30分の段階で「本日の整理券配布はすべて終了いたしました」というアナウンスが響くことも珍しくありません。SNS上で混雑状況リアルタイムを追うと、「11時に到着したがすでに当日の受付締め切り」「整理券をもらえたが指定時間は17時だった」という嘆きのポストが昼前後に集中して散見されます。訪問当日の朝、X（旧Twitter）のリアルタイム検索で「メガトウキョー 整理券」の直近30分以内の投稿を確認することは、必須の行動規範となっています。
