病気が進行・本格化するにつれて、症状の性質には明確なコントラストが現れます。最大の違いは幻覚や妄想の有無と、障害される精神機能の領域です。
統合失調症の症状は大きく2つに分かれます。存在しない声が聞こえる幻聴や「盗聴されている」と思い込む被害妄想といった陽性症状と、感情の起伏が乏しくなる感情平板化や自発性の喪失といった陰性症状です。物事の関連性を独自の論理で結びつけてしまう「思考の解体」も特徴です。
一方、うつ病の主な症状と診断基準（DSM-5-TRやICD-11準拠）では、「抑うつ気分」と「興味・喜びの著しい喪失」が中核です。罪業妄想（「自分が悪いせいで周囲に迷惑をかけた」と思い詰める）などの精神病症状を伴う重度のうつ病も存在しますが、統合失調症のような奇異で脈絡のない被害妄想とは質的に区別されます。
さらに認知機能障害の比較においても特徴的な違いが見られます。うつ病の認知機能低下は思考の回転が遅くなる「精神運動制止」が中心で、気分が回復すると認知機能も大幅に戻る傾向があります。対して統合失調症では、ワーキングメモリや情報処理速度の低下が病気そのものの基本障害として残存しやすく、長期的な生活リハビリテーションが必要になります。
