結婚後の家庭環境について、公の場で過剰に私生活を切り売りしない姿勢も山本耕史の一貫した哲学です。読者の検索需要で多い「子供は何人いるのか」という疑問について、公式発表および報道各社の取材データを整理すると、現在は2人の子どもに恵まれています。
2016年12月に第1子、2019年3月に第2子が誕生。堀北真希さんが2017年2月をもって家庭に専念するため芸能界を引退して以降、夫妻は都心の喧騒から離れた自然豊かなエリアに拠点を構え、子育て期に合わせた生活環境を整えています。
一部の週刊誌で時折囁かれる「別居説」や「不仲説」の真相は、山本耕史が東京での過密な撮影スケジュールをこなすための仕事部屋と、家族が暮らす本宅を行き来する計画的な生活設計が誤認されたものに過ぎません。学校行事や地域行事には積極的に顔を出し、料理上手としても知られる山本耕史が朝食作りや送迎を担当するなど、夫婦で明確な役割分担を敷いている様子が伝えられています。
