作りたての柚子胡椒は、唐辛子の尖った辛味と塩味が前面に出ています。仕込み直後は煮沸消毒した清潔なガラス瓶に空気が入らないよう隙間なく詰め、冷蔵庫で約1週間〜10日間寝かせることで、塩が馴染んで角が取れ、まろやかな旨味へと熟成します。
冷蔵保存でも3ヶ月程度は日持ちしますが、空気に触れる表面から酸化が進み、徐々に茶色く変色して香りが失われていきます。そこでおすすめなのが冷凍庫での保管です。塩分濃度が約20%ある柚子胡椒は、一般的な家庭用冷凍庫（マイナス18度前後）に入れてもカチカチに凍結せず、スプーンでそのまま削り取ることができます。柚子胡椒冷凍保存期間は約1年間。ラップで小分け密閉するか、遮光性の高い保存袋に入れて冷凍すれば、鮮やかな緑色と搾りたてのようなフレッシュな芳香を1年中いつでも楽しめます。
