アウトドアレジャーにおける最大の不安要素である天候ですが、しい茸園有馬富士の雨の日営業体制は極めて堅牢です。しいたけの発生ハウスからBBQ棟に至るまで頑丈な屋根付き施設で直結しており、土砂降りの雨であっても傘を差さずに全行程を完結させることが可能です。
ただし、雨天時の利用には独自の注意点が存在します。雨天時は周囲の屋外観光地（有馬富士公園の芝生広場など）から屋根のある当園へ客足が集中する傾向があり、屋内BBQ場の湿気と煙の滞留が晴天時より顕著になります。空調や大型換気扇は稼働していますが、匂い移りしても気にならないラフなアウトドアウェアで訪れるのが鉄則です。
一方、混雑状況に目を向けると、最も警戒すべきは10月から11月の秋の行楽シーズンです。この時期の土日祝日は、予約受付が開始されると瞬く間にランチタイム（11:00〜13:00）の枠が埋まります。公式発表資料や現地稼働状況を見ても、このピーク期間は完全事前予約で満席御礼となる日が珍しくありません。
予約方法は、公式サイトのオンライン予約システムおよび電話受付が基本です。2026年現在はWEB予約枠が拡充されているものの、週末利用を狙うのであれば利用希望日の1ヶ月〜1ヶ月半前には枠を押さえておくのが安全策です。また、JR新三田駅からの「無料送迎バス」を利用する場合、バスの座席も事前予約制となっているため、予約完了時に送迎の手配を同時に確定させる必要があります。
