結論から申し上げますと、ミスタードーナツ新宿靖国通りショップは現在営業しておらず、すでに閉店しています。現地を訪れても店舗は存在せず、別の商業テナントへ入れ替わっています。
ネット上では「近隣へ移転したのではないか」「歌舞伎町内の別区画でリニューアルオープンしたのでは」といった移転説が定期的に浮上しますが、これは事実ではありません。運営元であるダスキンによる公式発表を含め、新宿靖国通りショップの後継となる直営移転先は設置されておらず、店舗自体の完全撤退という形をとっています。
現在もマップ検索やSNSの過去ログなどで店名を見かける機会があるため営業中と錯覚しがちですが、訪問を予定している方は注意が必要です。