リニューアル以降、空間設計の思想が一新された館内は、マツダのブランドテーマカラーであるブラックと木目を基調としたシックなデザインで統一されています。展示フロアは全10のゾーンで構成され、創業時の「東洋コルク工業」時代から始まる100年以上のモノ造りスピリットが立体的に浮かび上がる演出です。
来場者の視線をまず奪うのが、戦前・戦後の復興を支えた三輪トラック「マツダ号」から、世界を震撼させた「コスモスポーツ」、そしてル・マン24時間レースで総合優勝を果たした伝説のレーシングカー「マツダ 787B（55号車）」の実車展示です。静態保存にとどまらず、現在も動態保存されている名車たちの放つ重厚な存在感は、写真や映像だけでは伝わらない強烈なリアリティを放っています。
館内デザインを手掛けた開発陣の証言資料によると、単なる「過去の振り返り」ではなく、「次の100年へ向けた挑戦の意思表明」として各ブースの光と動線が緻密に計算されている点が大きな特徴です。デザイン哲学「魂動（こどう）-Soul of Motion」のクレイモデルから実車への具現化プロセスなど、造形美の極致を体感できます。
