身曾岐神社の主祭神は、日本の総氏神である天照太神（あまてらすおおかみ）と、江戸時代後期の神道家で「みそぎ教」の開祖である天徳貴命（てんとくたかのみこと／井上正鉄翁神）です。「みそぎ」とは、心身に付着した罪や穢れ、執着や迷いを洗い流し、本来の澄み切った魂に立ち返ることを意味します。
参拝によって得られるご利益は多岐にわたりますが、とりわけ以下の分野で強力な神徳があると信じられています。
- 心身清浄・厄除開運：過去のトラウマや停滞した運気をリセットし、新たな出発を後押しする。
- 無病息災・病気平癒：境内から湧き出る御神水「光壽（こうじゅ）の水」に代表される、生命力の再生。
- 芸能上達・学業成就：能舞台を有する神域ならではの、感性向上や表現力・芸事の上達。
- 良縁成就・家内安全：清らかな心で人と結ばれるご縁結び。
その中でも参拝者が息をのむのが、毎日執り行われている神道古来の秘法「火祥神事（かしょうしんじ）」です。参拝者が願い事や祓いたい苦悩を書き記した木札（祈祷木）を、斎火（いみび）の猛烈な炎にくべ、神職が祝詞を奏上しながら燃え盛る炎とともに穢れを焼き清めます。夜間や特別祈祷で立ち上る火柱と太鼓の響きは圧巻の迫力であり、「胸のつかえが取れた」「視界が開けたような感覚を覚えた」と語る参拝者が後を絶ちません。
また、参拝作法にも独自の特徴があります。一般的な神社では「二拝二拍手一拝」ですが、身曾岐神社の本殿では「二拝八拍手一拝（にはいはちはくしゅいっぱい）」の古神道作法が推奨されています。八つの拍手は「末広がり」や「宇宙の調和」を意味し、澄んだ拍手の音が境内の静寂に心地よく響き渡ります。
